一般情況下，生物質鍋爐高效燃燒時的料層厚度常控制在300mm左右，且要盡量保持燃料層厚度不變，可調節爐排速度及風量。

當燃料著火燃燒穩定，且在后拱區有一定明火燃燒時，可調節爐排各風門開度。風門開度調節的原則為，前部風門開大，后部風門盡量關小。同時，開啟前后拱的二次風，二次風的風門開度大小視二次風開啟后火床上方火焰及煙氣流場而定。其調節原則為，開啟二次風將爐排上方的高溫煙氣壓向前拱區，促使燃料及時著火。正常運行時，著火線應控制在離引燃拱出口處100～200mm范圍內。著火過早，易引燃煤斗內燃料；過晚不利于燃料的燃盡。

燃料應在爐排尾部老鷹鐵前0.5米左右處燃燒完畢，灰渣呈暗色，在尾部應保持一定厚度的渣層，防止爐排直接暴露在火光之下。應經常注意，如發現紅光（包括暗紅未燒完的炭）堆積到老鷹鐵上時，應即撥火（把紅火向外推）讓其充分燃盡。發生“脫火”時，可在左側看火孔處用撥火鉤將后面已燃燒的燃料撥到新進入爐膛的燃燒層上，或投入木柴，加速著火。此外還應避免生物質鍋爐因長時間壓火所帶來的爐排過熱損壞或爐排長銷彎曲等。